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El efecto de esta medida fue inmediato y muestra la incidencia que la producción de biodiesel tiene sobre la cadena sojera, ya que desde el anuncio de la adecuación de la alícuota de exportación al biodiesel y hasta la fecha el aceite de soja aumentó su cotización en 50 dólares por tonelada, con el consiguiente impacto positivo en la generación de divisas de esta cadena que es una de los principales sostenes de la economía del país.
Asimismo, la industria remarcó la necesidad de sostener esta medida con una solución a la imprevisibilidad que genera el actual sistema de alícuotas móviles hoy vigente, que obliga a que tales alícuotas se fijen en la instancia del embarque y no al de la concertación del negocio. Eso provoca diferencias en el valor finalmente a pagar, generando incertidumbre en la previsión del resultado del negocio.
La cámara ya ha propuesto habilitar un registro de contratos de biodiesel que permita a la Aduana verificar la alícuota de retención vigente a la fecha del contrato, o retomar el sistema de alícuotas fijas, lo que sería una solución al permitir la comercialización anticipada del producto, requerimiento fundamental por la logística que exige el proceso de exportación.
Por otro lado, la operatoria en el mercado interno requiere un acomodamiento en el tratamiento tributario del biodiesel en relación al gasoil importado, para que se pueda poner en marcha la anunciada implementación del corte en generación eléctrica, medida sobre la cual el Gobierno Nacional envió un proyecto de ley que ya está cercano a su sanción en el Congreso de la Nación, y que pone en igualdad de condiciones a estos productos, y que de implementarse seguramente va a generar un importante ahorro de divisas por la sustitución de importaciones de gasoil con biodiesel de producción nacional.
Si bien hay que solucionar varios temas aún pendientes para que las empresas productoras y exportadoras de biodiesel vuelvan a funcionar a su capacidad plena, estas medidas recientemente anunciadas (y de sostenerse en el tiempo) seguramente posibilitarán retomar la generación de divisas con agregado de valor, sustituyendo importaciones de gasoil con un producto renovable 100 % de producción nacional, sosteniendo por otra parte los precios de la principal cadena de exportación como es la de la soja".
 
La menor exportación de biodiesel impacta en un mayor excedente de aceite de soja, lo que ocasiona menores precios y una mayor capacidad ociosa, que actualmente asciende al 40%, todo lo cual genera un menor ingreso de divisas al país.